Το λιμάνι της Σούδας βρίσκεται στον ομώνυμο όρμο και είναι το βασικό λιμάνι των Χανίων. Απέχει περίπου έξι χιλιόμετρα από το κέντρο της πόλης, με το οποίο συνδέεται με συχνά δρομολόγια των αστικών λεωφορείων αλλά και των λεωφορείων Κ.Τ.Ε.Λ. Σε κοντινή επίσης απόσταση βρίσκεται και το αεροδρόμιο των Χανίων. Τα ταξί επίσης κάνουν τη διαδρομή αυτή, που κοστίζει περίπου 15 ευρώ.
Στο λιμάνι της Σούδας φτάνουν καθημερινά πλοία από τον Πειραιά, με τον οποίο η σύνδεση είναι ούτως ή άλλως συχνή, ενώ κατά την τουριστική περίοδο τα ακτοπλοϊκά δρομολόγια πολλαπλασιάζονται.